Детство будущий актёр провёл на Чукотке, потом в Железноводске. В 1980 году вместе с семьёй он переехал в Саратов, где окончил театральное училище. После службы на флоте поступил в ГИТИС. Работал во многих театрах. В 1999 году Сергей Пускепалис был удостоен звания заслуженного России.