Хоакин Феникс родился родился 28 октября 1974 года в Пуэрто-Рико в семье миссионеров-сектантов. Позже его родителям удалось вернуться к обычной жизни и переехать во Флориду. Его мать Арлин начала работать в отделе кастинга канала NBC и всячески способствовала телевизионной карьере детей. Вскоре Хоакин стал сниматься в рекламе и телевизионных сериалах. Свою первую роль юный актер исполнил вместе со своим старшим братом Ривером в трагикомическом телепроекте "Семь невест для семи (1982).